連云港港位于我國東部沿海中部，江蘇省東北部，黃海海州灣東南岸，是我國中西部地區的便捷出海口，是國家規劃的能源和原材料運輸的重要口岸和重要的煤炭裝船港，也是橫貫中國東西的鐵路大動脈---隴海鐵路的東部終點港，被譽為新亞歐大陸橋東橋頭堡和新絲綢之路東端起點。連云港港南距上海港388海里，北距大連港346海里，東距韓國的釜山港522海里、日本的長崎港587海里。通過隴海鐵路西連我國中西部地區（陸路西距烏魯木齊3626千米）以至中亞諸國。港口地理位置得天獨厚，區位優勢顯著，對新亞歐大陸橋沿線地區經濟發展發揮著巨大作用，是我國以外貿運輸為主的綜合性國際貿易運輸主樞紐港之一。

連云港港由連云港區、贛榆港區、前三島港區、徐圩港區和灌河港區組成。港口現主要生產港區為連云港區，其他港區正在建設或規劃中。

連云港區為該港的主體港區，位于西大堤與后云臺山之間，該港區以集裝箱和大宗散貨運輸為主，兼顧客運和通用散雜貨運輸。港區劃分五個作業區，現主要生產作業區為馬腰、廟嶺、墟溝三個作業區。旗臺作業區和大堤作業區正在建設中。

馬腰作業區（原老港區），位于磨刀塘以西，建有萬噸級泊位13個，裝卸貨物主要有煤炭、液體化工產品和雜貨等。

廟嶺作業區，位于馬腰作業區西側，建有萬噸級泊位17個，裝卸貨物主要有集裝箱、糧食、煤炭、木材和雜貨等。

墟溝作業區，位于廟嶺作業區西側，建有萬噸級泊位9個，裝卸貨物主要有集裝箱、雜貨、礦石等。

贛榆港區，位于連云港區北側海州灣內，繡針河口與龍王河口之間。規劃為腹地經濟發展和后方臨港工業服務的綜合性港區，以干散貨、液體散貨和散雜貨運輸為主，并預留遠期發展集裝箱運輸的功能。

前三島港區，位于連云港東北海域，三島分別為平山島、達念山島和車牛山島。港區規劃以石油運輸為主、主要為大型石化產業發展服務。

徐圩港區，位于連云港市城區東南部，埒子口河以北。港區規劃依托臨港工業，并預留遠期發展大宗散貨、集裝箱等貨物轉運的功能。

灌河港區，位于連云港市灌南縣與鹽城響水縣交界處的灌河北畔。港區現有千噸級泊位3個，萬噸級泊位1個，規劃以散雜貨、化工品運輸為主，兼顧修造船功能，主要為地方經濟發展服務。